Recentemente a ABHH afiliou-se à Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência (SBPC). Atualmente, a SBPC possui seis mil sócios e representa mais de 100 sociedades científicas associadas, 20 conselhos e comissões governamentais. A SBPC participa ativamente de debates sobre questões que determinam os rumos das políticas de C&T e da educação no Brasil.

Tem assento permanente no Conselho Nacional de Ciência e Tecnologia (CCT), órgão consultivo do Governo Federal para definição das políticas e ações prioritárias no campo da C&T.

A entidade também contribui para o debate permanente das questões relacionadas à área por meio de diversas publicações, como o Jornal da Ciência, a revista Ciência e Cultura, o portal na internet e a edição de livros sobre temas diversos relacionados à ciência brasileira.